Quy Định Thuế TNDN Với Doanh Nghiệp FDI Mới Nhất 2025

Quy định thuế TNDN với doanh nghiệp FDI mới nhất 2025 theo Luật số 67/2025/QH15 sẽ bắt đầu áp dụng từ ngày 01/10/2025, đánh dấu một thay đổi lớn trong cách quản lý nghĩa vụ thuế đối với khối doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài tại Việt Nam. Các quy định mới bao gồm việc xác định đối tượng phải nộp, phạm vi thu nhập chịu thuế, mức thuế suất phân tầng, cùng nhiều ưu đãi thuế gắn với công nghệ cao, đổi mới sáng tạo và khu vực đầu tư ưu đãi.

Ngoài ra, doanh nghiệp FDI còn cần lưu ý đến giao dịch liên kết, cơ chế thuế tối thiểu toàn cầu và thủ tục chuyển lợi nhuận ra nước ngoài. Hiểu rõ những điểm này sẽ giúp doanh nghiệp lập kế hoạch thuế hiệu quả, tối ưu chi phí và đảm bảo tuân thủ pháp luật.

Mục lục

• 1.Cơ sở pháp lý
• II. Đối tượng và thu nhập chịu thuế của doanh nghiệp FDI
  • 1. Đối tượng nộp thuế 
  • 2. Thu nhập chịu thuế
  • 3. Thu nhập miễn thuế 
• III. Thuế suất và chính sách ưu đãi cho doanh nghiệp năm 2025
• IV. Nghĩa vụ đặc thù của doanh nghiệp FDI
  • 1. Giao dịch liên kết và chuyển giá
  • 2. Thuế tối thiểu toàn cầu (BEPS 2.0)
  • 3. Thuế nhà thầu với TNDN
  • 4. Hạn chế chi phí & vốn mỏng
  • 5. Quỹ KH&CN, kết chuyển lỗ, remittance
• V. Rủi ro thường gặp giải pháp tuân thủ

1.Cơ sở pháp lý

Luật Thuế Thu nhập Doanh nghiệp số 67/2025/QH15 chính thức có hiệu lực từ ngày 01/10/2025, thay thế toàn bộ các quy định cũ trước đó. Đây là một bước cải cách lớn, tạo hành lang pháp lý rõ ràng hơn cho doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài (FDI) hoạt động tại Việt Nam.

Một số điểm cần lưu ý

• Đối tượng áp dụng: mọi tổ chức có hoạt động SXKD và phát sinh thu nhập tại Việt Nam.
• Nguyên tắc cơ bản: thu nhập chịu thuế được xác định theo nguồn gốc phát sinh tại Việt Nam hoặc liên quan đến hoạt động của doanh nghiệp tại Việt Nam.
• Văn bản liên quan: nghị định và thông tư hướng dẫn sẽ chi tiết hóa thủ tục kê khai, ưu đãi, quản lý giao dịch liên kết, và cơ chế áp dụng thuế tối thiểu toàn cầu.

Doanh nghiệp FDI là nhóm chịu tác động trực tiếp, từ khâu thuế suất, ưu đãi, đến các cơ chế quản trị thuế hiện đại (APA, BEPS, GloBE).

Bất cứ doanh nghiệp FDI nào đang hoặc sắp đầu tư vào Việt Nam cần chuẩn bị kịch bản thuế mới từ cuối năm 2025, tránh bị động trong kế hoạch tài chính – pháp lý.

II. Đối tượng và thu nhập chịu thuế của doanh nghiệp FDI

1. Đối tượng nộp thuế 

• Công ty con: pháp nhân độc lập tại Việt Nam, chịu thuế TNDN đầy đủ.
• Chi nhánh: không phải pháp nhân, nhưng nộp thuế TNDN trên toàn bộ thu nhập liên quan đến hoạt động tại Việt Nam.
• Doanh nghiệp không hiện diện pháp nhân nhưng có PE (Permanent Establishment – cơ sở thường trú): ví dụ dự án xây dựng kéo dài, đại lý phụ thuộc, cung cấp dịch vụ số xuyên biên giới.
• Văn phòng đại diện (RO): không được phép kinh doanh; nếu vượt quá phạm vi giới thiệu, xúc tiến, nguy cơ bị coi là PE và phải chịu thuế TNDN.

2. Thu nhập chịu thuế

• Hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa – dịch vụ.
• Chuyển nhượng vốn, bất động sản, dự án đầu tư, quyền khai thác.
• Lãi tiền gửi, tiền vay, bản quyền, phí dịch vụ nội bộ tập đoàn, phí quản lý, phí nhượng quyền.
• Thu nhập phát sinh ở nước ngoài nhưng thuộc doanh nghiệp cư trú tại Việt Nam (được trừ số thuế đã nộp ở nước ngoài theo nguyên tắc tránh đánh thuế hai lần).

3. Thu nhập miễn thuế 

• Thu nhập từ nghiên cứu & phát triển (R&D), đổi mới sáng tạo, chuyển đổi số (tối đa miễn 3 năm).
• Thu nhập từ sản phẩm công nghệ mới trong giai đoạn thử nghiệm.
• Cổ tức, lợi nhuận được chia từ doanh nghiệp đã nộp thuế TNDN ở Việt Nam.
• Tài trợ hợp lệ cho giáo dục, y tế, KH&CN, từ thiện – nhân đạo.
• Tín chỉ các-bon, trái phiếu xanh được miễn theo cơ chế ưu đãi tài chính xanh.

Doanh nghiệp FDI phải phân loại rõ nguồn thu nhập, tách biệt phần được miễn và chịu thuế, đồng thời lưu trữ đầy đủ hồ sơ chứng minh.

III. Thuế suất và chính sách ưu đãi cho doanh nghiệp năm 2025

1. Thuế suất chuẩn theo quy mô

• 15%: doanh nghiệp có doanh thu năm trước ≤ 3 tỷ đồng.
• 17%: doanh nghiệp có doanh thu > 3 tỷ đến ≤ 50 tỷ đồng.
• 20%: mức phổ thông áp dụng cho hầu hết doanh nghiệp.

2. Thuế suất đặc thù

• 25% – 50% đối với khai thác dầu khí.
• 40% – 50% đối với khai thác tài nguyên quý hiếm, tùy địa bàn.

3. Ưu đãi theo ngành và địa bàn

• Công nghệ cao, công nghiệp hỗ trợ, tiết kiệm năng lượng, khu CNC, khu công nghệ số, khu kinh tế: được miễn thuế tối đa 4 năm và giảm 50% trong 9 năm tiếp theo.
• Startup đổi mới sáng tạo: miễn 2 năm, giảm 50% trong 4 năm, cộng ưu đãi đặc biệt cho chuyển nhượng cổ phần/vốn góp.
• DNNVV mới thành lập từ hộ kinh doanh: miễn 3 năm đầu.

4. Mốc thời gian ưu đãi

• Bắt đầu tính từ năm đầu tiên có thu nhập chịu thuế.
• Nếu 3 năm đầu kể từ khi có doanh thu chưa có lãi => ưu đãi tính từ năm thứ 4.
• Trường hợp được công nhận DN công nghệ cao muộn, ưu đãi bắt đầu từ năm cấp chứng nhận (không quá 3 năm kể từ đó).

Chính sách thuế TNDN 2025 mở rộng ưu đãi cho FDI, nhưng song song yêu cầu minh bạch hồ sơ để tránh lạm dụng.

IV. Nghĩa vụ đặc thù của doanh nghiệp FDI

1. Giao dịch liên kết và chuyển giá

• Nghĩa vụ lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết: master file, local file, báo cáo CbCR nếu tập đoàn đạt ngưỡng doanh thu toàn cầu.
• Các phương pháp định giá: CUP, RPM, TNMM, profit split.
• APA (Advance Pricing Agreement): công cụ hữu ích giảm rủi ro thanh tra, ổn định thuế dài hạn.

2. Thuế tối thiểu toàn cầu (BEPS 2.0)

• Doanh nghiệp FDI thuộc tập đoàn doanh thu hợp nhất ≥ ngưỡng quốc tế phải tuân thủ quy định QDMTT tại Việt Nam.
• Nếu ưu đãi thuế quá thấp, doanh nghiệp vẫn có thể phải nộp thêm “top-up tax” để đạt mức tối thiểu toàn cầu.
• Ưu đãi thuế truyền thống sẽ dần nhường chỗ cho các gói hỗ trợ bằng tiền mặt hoặc grant.

3. Thuế nhà thầu với TNDN

• Khi không có PE: áp dụng thuế nhà thầu đối với lãi vay, bản quyền, dịch vụ số, quảng cáo online.
• Khi hình thành PE: chuyển sang chịu thuế TNDN đầy đủ.

4. Hạn chế chi phí & vốn mỏng

• Lãi vay khống chế theo tỷ lệ EBITDA.
• Phí quản lý, phí bản quyền phải có hợp đồng, chứng từ và chứng minh lợi ích.
• Giao dịch nội bộ (IT, cloud, dữ liệu) cần phương pháp phân bổ hợp lý.

5. Quỹ KH&CN, kết chuyển lỗ, remittance

• Quỹ KH&CN: trích tối đa 20% thu nhập tính thuế, phải sử dụng trong 5 năm.
• Kết chuyển lỗ: tối đa 5 năm liên tiếp.

V. Rủi ro thường gặp giải pháp tuân thủ

1. Rủi ro phổ biến

• PE ẩn: văn phòng đại diện hoạt động vượt phạm vi.
• Phí dịch vụ nội bộ không đủ chứng minh lợi ích.
• Lãi vay vượt trần vốn mỏng.
• Sai thời điểm áp dụng miễn – giảm thuế.
• Không hạch toán tách bạch dự án ưu đãi.

2. Giải pháp tuân thủ

• Thực hiện checklist tự rà soát thuế định kỳ (PE, TP, FCT, ưu đãi).
• Chuẩn bị hồ sơ giao dịch liên kết đầy đủ, kịp thời.
• Kế hoạch trích quỹ KH&CN và theo dõi 5 năm.
• Xác định chính xác mốc miễn – giảm thuế để tránh kê khai sai.
• Chủ động trao đổi với cơ quan thuế về APA hoặc thỏa thuận trước khi phát sinh rủi ro.

Quy định thuế TNDN với doanh nghiệp FDI 2025 đặt ra nhiều thay đổi quan trọng về thuế suất, ưu đãi và nghĩa vụ quản lý thuế. Doanh nghiệp FDI cần nắm rõ để lập kế hoạch tài chính, tận dụng ưu đãi hợp pháp và hạn chế rủi ro thanh tra thuế.

Nếu bạn muốn hiểu sâu hơn cách áp dụng Luật mới vào thực tế, hãy tham khảo Khóa học Kế toán Doanh nghiệp FDI tại Kế toán Lê Ánh. Khóa học được thiết kế chuyên biệt, giúp học viên nắm chắc đặc thù kế toán – thuế FDI, quản lý giao dịch liên kết, lập báo cáo và quyết toán đúng chuẩn, từ đó tự tin đảm nhiệm vị trí kế toán – thuế trong các công ty FDI.